{"id":19591,"date":"2026-03-19T17:28:06","date_gmt":"2026-03-19T16:28:06","guid":{"rendered":"https:\/\/francelyme.fr\/site\/?p=19591"},"modified":"2026-03-19T17:28:06","modified_gmt":"2026-03-19T16:28:06","slug":"biofilms-bacteriens-et-antibioresistance-ce-que-les-travaux-de-linstitut-pasteur-signifient-pour-les-patients-atteints-de-lyme-long","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/francelyme.fr\/site\/biofilms-bacteriens-et-antibioresistance-ce-que-les-travaux-de-linstitut-pasteur-signifient-pour-les-patients-atteints-de-lyme-long\/","title":{"rendered":"Biofilms bact\u00e9riens et antibior\u00e9sistance : ce que les travaux de l&rsquo;Institut Pasteur signifient pour les patients atteints de Lyme long"},"content":{"rendered":"<div class=\"like-button\" style=\"float: right; clear: both; text-align: right; width = 100%;\">\n<!-- Facebook Like Button Vivacity Infotech BEGIN -->\n<div class=\"fb-like\" data-href=\"https:\/\/francelyme.fr\/site\/biofilms-bacteriens-et-antibioresistance-ce-que-les-travaux-de-linstitut-pasteur-signifient-pour-les-patients-atteints-de-lyme-long\/\" data-layout=\"box_count\" data-action=\"like\" data-show-faces=\"false\" data-size=\"large\" data-width=\"450\" data-share=\"1\" ><\/div><\/div>\n<!-- Facebook Like Button Vivacity Infotech END -->\n<div id=\"fb-root\"><\/div>\n<div class=\"wp-block-image\">\n<figure class=\"aligncenter size-full\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"605\" height=\"412\" src=\"https:\/\/francelyme.fr\/site\/wp-content\/uploads\/2026\/03\/Image2-2.jpg\" alt=\"\" class=\"wp-image-19592\" srcset=\"https:\/\/francelyme.fr\/site\/wp-content\/uploads\/2026\/03\/Image2-2.jpg 605w, https:\/\/francelyme.fr\/site\/wp-content\/uploads\/2026\/03\/Image2-2-300x204.jpg 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 605px) 100vw, 605px\" \/><\/figure>\n<\/div>\n\n\n<p>Il existe des d\u00e9couvertes scientifiques qui, \u00e0 premi\u00e8re vue, semblent tr\u00e8s \u00e9loign\u00e9es du quotidien des patients. Celle-ci n&rsquo;en fait pas partie. Les travaux publi\u00e9s par des chercheurs de l&rsquo;Institut Pasteur sur les biofilms bact\u00e9riens et leur r\u00f4le dans l&rsquo;antibior\u00e9sistance touchent directement \u00e0 des questions que des milliers de patients atteints de Lyme long posent depuis des ann\u00e9es : pourquoi les traitements ne fonctionnent-ils pas toujours ? Pourquoi les bact\u00e9ries peuvent-elles persister malgr\u00e9 des cures antibiotiques conformes aux recommandations ? Pourquoi certaines infections ne ressemblent-elles pas aux infections \u00ab\u00a0classiques\u00a0\u00bb que la m\u00e9decine sait traiter ?<\/p>\n\n\n\n<p>Ces travaux n&rsquo;apportent pas encore de r\u00e9ponse d\u00e9finitive \u00e0 ces questions. Mais ils apportent quelque chose d&rsquo;essentiel : un cadre scientifique rigoureux pour commencer \u00e0 y r\u00e9pondre s\u00e9rieusement.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Ce qu&rsquo;est un biofilm, et pourquoi cela change tout<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Pour comprendre l&rsquo;importance de ces recherches, il faut d&rsquo;abord se d\u00e9faire d&rsquo;une image trop simpliste des bact\u00e9ries. Dans les manuels scolaires, une bact\u00e9rie est un organisme unicellulaire isol\u00e9, flottant librement dans un milieu biologique, identifiable et ciblable par un antibiotique. Cette repr\u00e9sentation existe depuis pr\u00e8s de 150 ans. Elle est commode. Elle est surtout incompl\u00e8te.<\/p>\n\n\n\n<p>Les bact\u00e9ries sont des microorganismes capables de se rassembler en communaut\u00e9s et, lorsque cela arrive, de former un biofilm : un \u00e9cosyst\u00e8me qui peut notamment les prot\u00e9ger des agressions ext\u00e9rieures.&nbsp; Cette organisation n&rsquo;est pas anecdotique : c&rsquo;est un mode de vie adopt\u00e9 par une grande partie des bact\u00e9ries pathog\u00e8nes dans des conditions d\u00e9favorables, pr\u00e9cis\u00e9ment lorsqu&rsquo;elles sont sous pression, notamment sous l&rsquo;effet des antibiotiques.<\/p>\n\n\n\n<p>Au sein d&rsquo;un biofilm, les bact\u00e9ries produisent une matrice extracellulaire complexe, compos\u00e9e de polysaccharides, de prot\u00e9ines et d&rsquo;ADN extracellulaire. Cette matrice forme une structure tridimensionnelle dense qui joue un r\u00f4le actif dans la protection des bact\u00e9ries qu&rsquo;elle abrite. Elle r\u00e9gule les \u00e9changes avec l&rsquo;environnement, filtre certaines mol\u00e9cules, et maintient des conditions physico-chimiques favorables \u00e0 la survie bact\u00e9rienne. \u00c0 l&rsquo;int\u00e9rieur de cette structure, les bact\u00e9ries modifient profond\u00e9ment leur comportement : elles ralentissent leur m\u00e9tabolisme, modifient l&rsquo;expression de leurs g\u00e8nes, et d\u00e9veloppent des comportements collectifs coordonn\u00e9s via un syst\u00e8me de communication chimique appel\u00e9 le quorum sensing. En d&rsquo;autres termes, une bact\u00e9rie en biofilm n&rsquo;est plus du tout la m\u00eame entit\u00e9 qu&rsquo;une bact\u00e9rie libre.<\/p>\n\n\n\n<p>Les chercheurs de l&rsquo;Institut Pasteur \u00e9tudient les strat\u00e9gies d&rsquo;\u00e9chappement th\u00e9rapeutique favorisant la r\u00e9sistance, notamment au sein des biofilms, d\u00e9finis comme des communaut\u00e9s de microbes qui s&rsquo;agr\u00e8gent et s&rsquo;attachent \u00e0 une surface vivante ou inerte, en produisant une matrice protectrice de substances visqueuses.&nbsp;<a href=\"https:\/\/www.pasteur.fr\/fr\/journal-recherche\/dossiers\/resistance-aux-antimicrobiens-enrayer-menace-sanitaire\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Institut Pasteur<\/a><\/p>\n\n\n\n<p><strong>Les m\u00e9canismes pr\u00e9cis par lesquels les biofilms favorisent l&rsquo;antibior\u00e9sistance<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>C&rsquo;est ici que les travaux de l&rsquo;Institut Pasteur deviennent particuli\u00e8rement instructifs. Dans une \u00e9tude publi\u00e9e en mars 2023 dans la revue&nbsp;<em>Communications Biology<\/em>, des chercheurs de l&rsquo;Institut Pasteur et de l&rsquo;Universit\u00e9 d&rsquo;Hokkaido ont mesur\u00e9 les effets de traitements r\u00e9p\u00e9t\u00e9s chez la bact\u00e9rie&nbsp;<em>Escherichia coli<\/em>. Ils ont d\u00e9montr\u00e9 qu&rsquo;appliquer des doses r\u00e9p\u00e9t\u00e9es d&rsquo;un antibiotique sur le biofilm de ces bact\u00e9ries non seulement ne permet pas leur \u00e9limination, mais entra\u00eene aussi le d\u00e9veloppement de leur r\u00e9sistance \u00e0 cet antibiotique.&nbsp;Le m\u00eame traitement appliqu\u00e9 \u00e0 des bact\u00e9ries libres conduit, lui, \u00e0 une forte mortalit\u00e9 sans d\u00e9veloppement de r\u00e9sistance. La diff\u00e9rence n&rsquo;est donc pas dans la bact\u00e9rie elle-m\u00eame, mais dans son mode d&rsquo;organisation.<\/p>\n\n\n\n<p>Plusieurs m\u00e9canismes expliquent ce ph\u00e9nom\u00e8ne :<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>La matrice extracellulaire constitue une barri\u00e8re physique et chimique qui ralentit consid\u00e9rablement la diffusion des antibiotiques. Certaines mol\u00e9cules th\u00e9rapeutiques sont neutralis\u00e9es avant m\u00eame d&rsquo;atteindre les bact\u00e9ries cibles. Les microbes d&rsquo;un biofilm peuvent \u00eatre 100 \u00e0 1 000 fois plus r\u00e9sistants aux antimicrobiens qu&rsquo;\u00e0 l&rsquo;\u00e9tat libre.\u00a0<\/li>\n\n\n\n<li>Les biofilms contiennent une proportion significative de bact\u00e9ries en \u00e9tat dormant, qui ont r\u00e9duit leur activit\u00e9 m\u00e9tabolique au minimum. Or la grande majorit\u00e9 des antibiotiques agissent sur des processus cellulaires actifs, comme la synth\u00e8se de la paroi bact\u00e9rienne ou la r\u00e9plication de l&rsquo;ADN. Des bact\u00e9ries qui ne se divisent plus deviennent de fait insensibles \u00e0 ces m\u00e9canismes d&rsquo;action. Elles survivent au traitement, puis reprennent leur activit\u00e9 une fois la pression antibiotique lev\u00e9e.<\/li>\n\n\n\n<li>La r\u00e9sistance accrue observ\u00e9e s&rsquo;expliquerait par un taux de mutation \u00e9lev\u00e9, une capacit\u00e9 accrue d&rsquo;adh\u00e9sion et une tol\u00e9rance protectrice associ\u00e9es aux biofilms.\u00a0<a href=\"https:\/\/www.biologiste365.fr\/actualites\/antibioresistance\/biofilms-et-emergence-de-lantibioresistance-nouvelles-decouvertes\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Biologiste365<\/a>\u00a0Des mutations sp\u00e9cifiques, absentes des populations de bact\u00e9ries libres soumises aux m\u00eames traitements, sont rapidement s\u00e9lectionn\u00e9es au sein des biofilms.<\/li>\n\n\n\n<li>Tout ce qui va stresser les bact\u00e9ries va favoriser les transferts horizontaux, notamment dans les biofilms o\u00f9 les bact\u00e9ries sont concentr\u00e9es.\u00a0<a href=\"https:\/\/www.pasteur.fr\/fr\/journal-recherche\/actualites\/antibioresistance-ou-comment-bacteries-deviennent-resistantes\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Institut Pasteur<\/a>\u00a0Ces transferts horizontaux de g\u00e8nes, dans lesquels les bact\u00e9ries \u00e9changent du mat\u00e9riel g\u00e9n\u00e9tique incluant des g\u00e8nes de r\u00e9sistance, sont massivement acc\u00e9l\u00e9r\u00e9s au sein de la matrice. Les chercheurs ont identifi\u00e9 des contr\u00f4les g\u00e9n\u00e9tiques favorisant la formation des biofilms, sugg\u00e9rant que cibler cette \u00e9tape pourrait \u00eatre une approche pour limiter la transmission de la r\u00e9sistance aux antibiotiques.\u00a0<a href=\"https:\/\/www.pasteur.fr\/fr\/journal-recherche\/actualites\/comprendre-transmission-resistance-aux-antibiotiques-staphylocoque-dore\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Institut Pasteur<\/a><\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<p>Le biofilm agit donc comme un v\u00e9ritable acc\u00e9l\u00e9rateur \u00e9volutif, dans lequel les r\u00e9sistances se d\u00e9veloppent et se propagent bien plus vite que dans une population bact\u00e9rienne libre.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Un enjeu qui d\u00e9passe largement les infections nosocomiales<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>On associe souvent les biofilms aux infections hospitali\u00e8res, aux cath\u00e9ters, aux proth\u00e8ses. Les biofilms form\u00e9s \u00e0 la surface des muqueuses ou de certains dispositifs m\u00e9dicaux sont tr\u00e8s difficiles \u00e0 \u00e9liminer, ce qui augmente consid\u00e9rablement les risques d&rsquo;infection.&nbsp;Ils seraient impliqu\u00e9s dans plus de 60 % des infections acquises \u00e0 l&rsquo;h\u00f4pital.&nbsp;<a href=\"https:\/\/www.pasteur.fr\/sites\/default\/files\/rubrique_espace_presse\/documents_de_presse\/dossiers_de_presse\/dp_2019\/dp_institut_pasteur_antibioresistance_0.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Institut Pasteur<\/a>&nbsp;C&rsquo;est une r\u00e9alit\u00e9 bien document\u00e9e et pr\u00e9occupante.<\/p>\n\n\n\n<p>Mais r\u00e9duire la probl\u00e9matique des biofilms aux seules infections nosocomiales serait une erreur. Les m\u00e9canismes d\u00e9crits dans ces travaux concernent potentiellement toutes les situations dans lesquelles une bact\u00e9rie pathog\u00e8ne est soumise \u00e0 une pression antibiotique r\u00e9p\u00e9t\u00e9e sans \u00eatre \u00e9limin\u00e9e : c&rsquo;est-\u00e0-dire pr\u00e9cis\u00e9ment les situations d&rsquo;infections persistantes, que la m\u00e9decine peine encore \u00e0 mod\u00e9liser et \u00e0 traiter.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Le lien avec<\/strong><strong>&nbsp;<\/strong><em><strong>Borrelia<\/strong><\/em><strong>&nbsp;<\/strong><strong>et le Lyme long : une hypoth\u00e8se s\u00e9rieuse<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>C&rsquo;est ici que ces travaux prennent une r\u00e9sonance particuli\u00e8re pour la communaut\u00e9 des patients Lyme. Depuis plusieurs ann\u00e9es, des \u00e9quipes de recherche internationales documentent la capacit\u00e9 de&nbsp;<em>Borrelia burgdorferi<\/em>, la bact\u00e9rie responsable de la maladie de Lyme, \u00e0 adopter des formes morphologiques tr\u00e8s diff\u00e9rentes de la forme spiroch\u00e8te classique. Parmi ces formes atypiques, on distingue notamment :<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>Les formes kystiques, ou formes rondes, dans lesquelles la bact\u00e9rie se replie sur elle-m\u00eame et r\u00e9duit son activit\u00e9 m\u00e9tabolique au minimum<\/li>\n\n\n\n<li>Les formes sans paroi cellulaire, appel\u00e9es formes L, qui \u00e9chappent aux antibiotiques ciblant la synth\u00e8se de la paroi<\/li>\n\n\n\n<li>Les structures agr\u00e9g\u00e9es, proches des biofilms, dans lesquelles plusieurs bact\u00e9ries s&rsquo;associent au sein d&rsquo;une matrice protectrice commune<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<p>Ces formes ont \u00e9t\u00e9 observ\u00e9es en laboratoire dans plusieurs \u00e9tudes, et certaines recherches sugg\u00e8rent leur existence possible dans des tissus humains pr\u00e9lev\u00e9s sur des patients pr\u00e9sentant des sympt\u00f4mes persistants malgr\u00e9 un traitement antibiotique standard.<\/p>\n\n\n\n<p>Il faut \u00eatre pr\u00e9cis sur ce point : le r\u00f4le exact de ces formes dans la physiopathologie du Lyme long reste d\u00e9battu, et les preuves directes chez l&rsquo;humain demeurent insuffisantes pour en tirer des conclusions th\u00e9rapeutiques d\u00e9finitives. Mais dans le contexte scientifique ouvert par les travaux de l&rsquo;Institut Pasteur, les \u00e9carter sans investigation s\u00e9rieuse n&rsquo;est plus d\u00e9fendable. Ces travaux offrent pr\u00e9cis\u00e9ment le cadre m\u00e9canistique qui manquait pour explorer ces hypoth\u00e8ses avec la rigueur qu&rsquo;elles m\u00e9ritent.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Ce que cela change pour la compr\u00e9hension du PTLDS<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>La reconnaissance du Lyme long, ou PTLDS (Post-Treatment Lyme Disease Syndrome), par la Haute Autorit\u00e9 de Sant\u00e9 constitue une \u00e9tape importante. Elle valide officiellement que des patients peuvent pr\u00e9senter des sympt\u00f4mes persistants et invalidants apr\u00e8s une infection \u00e0&nbsp;<em>Borrelia<\/em>, m\u00eame apr\u00e8s un traitement antibiotique conforme aux recommandations. C&rsquo;est une avanc\u00e9e r\u00e9elle.<\/p>\n\n\n\n<p>Mais cette reconnaissance reste incompl\u00e8te tant qu&rsquo;elle ne s&rsquo;accompagne pas d&rsquo;une volont\u00e9 d&rsquo;explorer s\u00e9rieusement les m\u00e9canismes biologiques qui sous-tendent ces sympt\u00f4mes. Les travaux de l&rsquo;Institut Pasteur rappellent une r\u00e9alit\u00e9 que les patients connaissent bien : une infection ne se traite pas toujours de la m\u00eame fa\u00e7on selon que la bact\u00e9rie est libre ou organis\u00e9e en biofilm, active ou dormante, accessible ou prot\u00e9g\u00e9e par une matrice. Continuer \u00e0 appliquer un sch\u00e9ma th\u00e9rapeutique con\u00e7u pour une infection aigu\u00eb \u00e0 une situation clinique qui ne l&rsquo;est manifestement plus, c&rsquo;est s&rsquo;assurer de rester dans une impasse.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Quelles pistes de recherche faut-il ouvrir ?<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Les implications pratiques de ces avanc\u00e9es sont concr\u00e8tes. Plusieurs axes m\u00e9ritent d&rsquo;\u00eatre d\u00e9velopp\u00e9s en priorit\u00e9 :<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>Caract\u00e9riser pr\u00e9cis\u00e9ment les formes atypiques de\u00a0<em>Borrelia<\/em>\u00a0dans des pr\u00e9l\u00e8vements tissulaires humains, en utilisant des techniques d&rsquo;imagerie et de biologie mol\u00e9culaire adapt\u00e9es<\/li>\n\n\n\n<li>\u00c9valuer l&rsquo;efficacit\u00e9 de strat\u00e9gies th\u00e9rapeutiques ciblant sp\u00e9cifiquement les biofilms, notamment des combinaisons d&rsquo;antibiotiques, des agents dispersants ou des mol\u00e9cules capables de perturber le quorum sensing<\/li>\n\n\n\n<li>Explorer des approches combin\u00e9es agissant simultan\u00e9ment sur les bact\u00e9ries en phase active, les formes dormantes et la matrice extracellulaire<\/li>\n\n\n\n<li>D\u00e9velopper des alternatives th\u00e9rapeutiques comme la phagoth\u00e9rapie, les peptides antimicrobiens, les combinaisons de m\u00e9dicaments ou les anticorps bisp\u00e9cifiques, dans le cadre d&rsquo;une r\u00e9flexion \u00e9largie aux infections persistantes<\/li>\n\n\n\n<li>\u00c9tudier le r\u00f4le de l&rsquo;inflammation chronique de bas grade induite par les biofilms dans la gen\u00e8se des sympt\u00f4mes persistants, en particulier la fatigue, les douleurs diffuses et les troubles cognitifs<\/li>\n\n\n\n<li>Int\u00e9grer l&rsquo;exp\u00e9rience clinique des patients dans la construction des protocoles de recherche, car ce sont eux qui, depuis des ann\u00e9es, signalent des patterns que la m\u00e9decine peine encore \u00e0 mod\u00e9liser<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<p><strong>Des raisons concr\u00e8tes d&rsquo;esp\u00e9rer<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Derri\u00e8re ces publications scientifiques, il y a des centaines de milliers de personnes qui attendent, souvent depuis des ann\u00e9es, une prise en charge r\u00e9ellement adapt\u00e9e \u00e0 leur situation. Mais il y a aussi, aujourd&rsquo;hui, des raisons concr\u00e8tes d&rsquo;esp\u00e9rer.<\/p>\n\n\n\n<p>Le programme de recherche lanc\u00e9 par l&rsquo;INSERM, avec ses cohortes prospectives suivies sur plusieurs ann\u00e9es, repr\u00e9sente une opportunit\u00e9 r\u00e9elle de changer la donne. C&rsquo;est pr\u00e9cis\u00e9ment ce type de dispositif scientifique rigoureux et de longue haleine qui permettra d&rsquo;explorer s\u00e9rieusement les m\u00e9canismes \u00e9voqu\u00e9s dans cet article : formes persistantes de&nbsp;<em>Borrelia<\/em>, structures de type biofilm, inflammation chronique, r\u00e9ponses immunitaires atypiques. Nous esp\u00e9rons sinc\u00e8rement que ces axes figureront parmi les priorit\u00e9s de ce programme, car ce sont eux qui ouvriront enfin la voie vers des th\u00e9rapeutiques adapt\u00e9es aux patients atteints de PTLDS.<\/p>\n\n\n\n<p>En attendant ces avanc\u00e9es, les patients sont en stand-by. Pas r\u00e9sign\u00e9s, mais en attente d&rsquo;une science qui les rejoigne l\u00e0 o\u00f9 ils en sont. Les travaux de l&rsquo;Institut Pasteur sur les biofilms montrent que cette science progresse, que les bonnes questions commencent \u00e0 \u00eatre pos\u00e9es, et que des r\u00e9ponses ne sont peut-\u00eatre plus si loin.<\/p>\n\n\n\n<p>Source&nbsp;: <a href=\"https:\/\/www.pasteur.fr\/fr\/journal-recherche\/actualites\/biofilms-formes-bacteries-peuvent-favoriser-emergence-antibioresistances?gad_source=1&amp;gad_campaignid=23002299786&amp;gbraid=0AAAAAD3JwGrdu9vHL7yka6pcvkIq_jjVo&amp;gclid=Cj0KCQjwmunNBhDbARIsAOndKpmQTU0Xzt5-NbgPFQz0QlQRBL4GUrjYbUhqzj7y-sfmvlzeMy6ISDUaAi1-EALw_wcB\">https:\/\/www.pasteur.fr\/fr\/journal-recherche\/actualites\/biofilms-formes-bacteries-peuvent-favoriser-emergence-antibioresistances?gad_source=1&amp;gad_campaignid=23002299786&amp;gbraid=0AAAAAD3JwGrdu9vHL7yka6pcvkIq_jjVo&amp;gclid=Cj0KCQjwmunNBhDbARIsAOndKpmQTU0Xzt5-NbgPFQz0QlQRBL4GUrjYbUhqzj7y-sfmvlzeMy6ISDUaAi1-EALw_wcB<\/a><\/p>\n\n\n\n<p><\/p>\n<div class=\"like-button\" style=\"float: right; clear: 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